La historia de gobierno de la institución de Oruro —estructurada formalmente hoy como el Gobierno Autónomo Departamental de Oruro— ha evolucionado desde el control colonial español y las juntas revolucionarias hasta convertirse en un gobierno subnacional descentralizado y autónomo.
Antes de existir una administración departamental, el territorio giraba en torno a la Real Villa de San Felipe de Austria y su gesta libertaria de 1781. El 5 de septiembre de 1826, el Mariscal Sucre promulgó la ley que erigió el nuevo departamento de Oruro, conformado por tres provincias: Oruro, Paria y Carangas, dando origen a la Prefectura.
Desde el 5 de septiembre de 1826 hasta el 18 de diciembre de 2005, la institución fue la Prefectura de Oruro. Durante casi 180 años, el Prefecto fue designado directamente por el Presidente de la República, actuando como brazo operativo del Ejecutivo nacional. Esta era centralista concluyó el 18 de diciembre de 2005 con las primeras elecciones democráticas de Prefectos por voto popular directo en Bolivia.
En 1995 se promulgó la Ley de Descentralización Administrativa, creando el Consejo Departamental. El verdadero punto de quiebre ocurrió en 2005, cuando los orureños, tras intensas luchas sociales, acudieron a las urnas para elegir democráticamente a su Prefecto por primera vez.
Con la Nueva Constitución (2009) y la Ley Marco de Autonomías (2010), la Prefectura dio paso al Gobierno Autónomo Departamental de Oruro (GADOR). El "Prefecto" pasó a ser "Gobernador" electo, y el Consejo fue reemplazado por la Asamblea Legislativa Departamental con facultad legislativa propia.
Santos Tito (2010-2015) fue el primer Gobernador bajo la nueva Constitución. Le siguió Víctor Hugo Vásquez, quien renunció por la crisis de 2019. Posteriormente, los gobernadores interinos Zenón Pizarro y Edson Oczachoque estabilizaron la Gobernación durante la pandemia.
Johnny Vedia Rodríguez asumió como Gobernador con el desafío de reactivar el departamento, gestionar el sistema de salud tras la pandemia, y enfocar esfuerzos en el desarrollo productivo e industrial de la región.
Tras dos vueltas electorales (marzo y abril de 2026), Eddgar Sánchez asumió como actual Gobernador. Su gestión inició con el restablecimiento del diálogo interinstitucional y acuerdos estratégicos de infraestructura, como la carretera Crucero–Qaqachaca–Pocoata.